В соответствии с законом о сотрудничестве с Международным трибуналом для бывшей Югославии (МТБЮ) Караджича доставили в следственный изолятор суда по военным преступлениям в Белграде.
В Белграде после новости о задержании Караджича группа молодых людей собралась на площади Республики в центре сербской столицы, чтобы высказать поддержку арестованному, и была задержана полицией.
Вблизи оцепленного полицией здания суда, куда был доставлен Караджич, собралась другая группа молодых людей, одетых в майки с эмблемой ультранационалистического движения "Образ", которые время от времени скандировали имя бывшего лидера боснийских сербов.
В центре столицы Сербии увеличено число полицейских, дополнительная охрана выставлена у посольства США.
Среди мусульман, составляющих большинство населения столицы БиГ города Сараево, известие о задержании Караджича вызвало всплеск радости.
На дождь на городских улицах в ночь на вторник собрались большие группы людей, распевающих победные песни, многие из них держали белые боснийские флаги середины 1990-х годов. Также по городу колоннами разъезжали автомобили с национальными флагами, водители которых гудели в клаксоны. По сообщению полиции Сараево, в городе усилили меры безопасности, но инцидентов зафиксировано не было.
Задержание бывшего лидера сербов БиГ вызвало позитивные отклики в НАТО, МТБЮ и Белом доме.
Караджич начал заниматься политикой, когда "Большая" Югославия, детище Тито, доживала последние годы – в 1989 году, когда основал Сербскую демократическую партию, которую сам и возглавил.
После провозглашения Республики Сербского Народа Боснии и Герцеговины (БиГ) 9 января 1992 года, позже переименованной в Республику Сербскую БиГ, Караджич стал ее первым президентом.
В 1992 году, после первых межэтнических столкновений в БиГ, он отдал распоряжение о формировании местных сербских вооруженных сил, основу которой составили военные бывшей Югославской Народной армии.
Все время войны в БиГ в 1992-1995 годах Караджич возглавлял боснийских сербов и совместно с командующим армией Республики Сербской БиГ Ратко Младичем планировал военные операции против местных мусульман и хорватов.
25 июля 1995 года МТБЮ выдвинул первые обвинения против Караджича и Младича по 16 пунктам, в том числе один по статье "геноцид" и три – за "преступления против человечности".
Второе обвинение по 20 пунктам относилось к событиям в мусульманском анклаве Сребреница, и было выдвинуто 16 ноября 1995 года. Армия боснийских сербов под командованием генерала Младича напала на Сребреницу 6 июля 1995 года и полностью заняла город через пять дней. До 19 июля, по данным МТБЮ, она истребила порядка восьми тысяч мусульман. Около 30 тысяч женщин и детей были депортированы из города.
В 1996 году под давлением международной общественности и тогдашнего лидера Югославии Слободана Милошевича Караджич передал свои полномочия тогдашнему вице-президенту Республики Сербской Биляне Плавшич и перестал появляться на людях.