ЛЕКАРСТВО ОТ РАКА СОЗДАЮТ В ИНТЕРНЕТЕ

За последние 50 лет для борьбы с раком создано около 40 лекарств. Но их побочные эффекты очень тяжелы. И вот помочь медикам решили... программисты: основываясь на разработках микробиологов, они своими методами ищут новое средство и призывают к этому всех пользователей ПК.

НАЙТИ ЭТО СРЕДСТВО МОЖЕТ КАЖДЫЙ

Ученые химического факультета Оксфордского университета и Национального фонда США по исследованию рака создали совместный проект United Research для поиска нового лекарства от рака через... Интернет.

Дело в том, что определить, какой именно ген вызывает рак, а какой может спасти от него -- невозможно: слишком много их участвует в развитии раковой опухоли. Исследования показали, что такой "панацеей" мог бы стать белок окислительного стресса -- супероксиддисмутаза, который помогает вырабатывать энергию в клетке и нейтрализовать свободные радикалы, попадающие к нам из атмосферы и вызывающие мутации в ней. Про то, что этот белок защищает клетки от воздействия извне, знали давно -- недаром же он входит практически во все косметические средства. Сейчас доказали: количество белка в раковой клетке понижено, а если его увеличить, то это приведет к ее гибели.

Ученые многих стран составили каталоги молекул, которые могут вести себя как лекарства и взаимодействовать с белком, но таких каталогов сотни у специалистов всего мира. В них нужно найти те необходимые, которые станут лекарством от рака. Это требует громадных вычислительных ресурсов. Чтобы снять проблему, и открыли необычный проект. Его участникам передается программа, анализирующая молекулы лекарств, карта белка и база данных, разделенная на "блоки для обработки" -- по сто молекул каждый. Программист моделирует "момент лечения" -- создает развернутую структуру белка и по очереди пристыковывает к нему мелкие молекулы из банка данных. Проанализировав первый блок молекул, он отсылает полученную информацию обратно в обмен на следующий блок.

К проекту может подключиться каждый, у кого дома стоит компьютер -- нужно лишь "скачать" программу, которая может искать лекарство, когда вы не работаете с ПК. Ее создатели обещают: она не принесет вреда вашему компьютеру и не передаст в сеть какие-либо ваши данные. Кроме того, это вам ничего не будет стоить! Тем более, что даже новейшие суперкомпьютеры не идут ни в какое сравнение с суммарной мощностью сотен тысяч энтузиастов по всему миру. Статистика показывает, что уже на сегодняшний момент в проекте участвуют около 900 000 пользователей и около 1 900 000 компьютеров. Общее вычислительное время, потраченное на проект, уже составило 165 тысяч лет.

В дальнейшем все полученные результаты будут сведены вместе. Молекулы, у которых сила взаимодействия была наибольшей, будут отдельно проанализированы и сравнены друг с другом, чтобы определить, что позволило им увеличить концентрацию белка. После завершения "виртуального" отбора начнутся лабораторные исследования и, возможно, его промышленное производство.

БЕССМЕРТИЕ КЛЕТОК РАЗРУШИТ ИХ БЕЛОК

За комментариями мы обратились в Институт молекулярной биологии и генетики.

-- Сейчас в научном мире идут споры о том, как конкретно действует супероксиддисмутаза: то ли самостоятельно, то ли просто позволяет повысить концентрацию давно используемого для лечения рака препарата Интерликин 2, -- говорит завоотделом структуры и функции нуклеиновых кислот Валерий Филоненко. -- Лекарство активирует в организме лимфоциты, которые распознают и уничтожают раковые клетки, однако очень большая концентрация его в организме опасна для сердца. Но то, что супероксиддисмутаза участвует в процессе борьбы с раковой опухолью -- бесспорно. Для повышения концентрации этого белка в больных клетках надо искусственно создать его первичную структуру. Для чего вполне разумно использовать компьютерное моделирование клетки. Тогда мы поймем, как он работает, и сможем создать или лекарство, воздействующее на него, повышая концентрацию, или искусственный аналог белка, который будем давать пациентам для этой цели.

Существует еще одна проблема, которую сейчас пробуют решить наши ученые: создать макромолекулы-маркеры, способные отличать раковые клетки от здоровых. Если им это удастся, то лечение химическими препаратами будет более эффективным, потому что сейчас эти средства воздействуют не только на злокачественную клетку, но и на все здоровые, находящиеся рядом с ней. Человек может умереть раньше -- не от рака, а от последствий его лечения. Тем более, что раковая клетка все время совершенствуется, становится более устойчивой к лекарствам.

Но самое главное, что расчет белковых структур может помочь найти лекарство не только от этого страшного заболевания, но и от болезни Альцгеймера, "коровьего бешенства", врожденной эмфиземы. Так что, может, и стоит помочь ученым найти панацею от стольких болезней?